孕36周查分泌物的目的是检查孕妇是否存在妇科感染，若在孕晚期孕妇出现妇科感染，可能会对孕妇和胎儿产生不良影响，需要在医生指导下进行规范化治疗。

如果孕晚期存在妇科炎症，可能在孕晚期引发胎膜早破，或引起绒毛膜羊膜炎，引发流产或早产。另外，如果需要剖宫产，还容易在剖宫产后出现感染，或在顺产后引发子宫内膜炎等。此外，还可能感染胎儿，引发新生儿肺炎、新生儿败血症等疾病，严重时可能导致新生儿死亡。如果孕36周查分泌物发现存在妇科感染，建议给予对症治疗，一般建议孕妇遵医嘱使用抗生素进行相应的治疗，以降低胎儿感染的几率，如头孢克洛颗粒、头孢克肟颗粒等，如果孕妇在临产前出现胎膜早破的情况，则需要提前应用抗生素预防感染。

孕36周一定要注意个人卫生，避免不洁性行为，同时每日更换内裤，并在阳光下暴晒杀菌，避免久坐，避免劳累。