左侧附件囊肿会不会影响怀孕主要是看囊肿的性质、大小，根据个人具体情况综合分析才能判定。

左侧附件囊肿一般分为生理性囊肿和病理性囊肿两类。

1、生理性囊肿，囊肿大小一般在5CM以下，超声检查中呈现出无回声区、边界比较清晰且无血流信号等特点，一般不需要治疗，如黄体囊肿、滤泡囊肿等，通常不影响怀孕，建议患者在2-3个月后月经周期结束后进行复查，如果囊肿消失，则多考虑为生理性囊肿。

2、病理性囊肿，囊肿可大可小，超声检查中呈现出囊内有密集的光点回声或强回声，者有界不清、血流信号等特点，如果囊肿较大或考虑恶性可能，建议积极手术，如果囊肿考虑良性且较小，可考虑观察。

患者应先去医院确诊囊肿属于生理性还是病理性，然后在专业医生指导下进行对症的治疗。